1. 國立澎湖科技大學校長(106.8-110.7)
2. 國立澎湖科技大學海洋資源暨工程學院第4任院長(101.8-104.7)
3. 國立澎湖科技大學海洋資源暨工程學院第3任院長(98.10-101.7)
4. 國立澎湖科技大學箱網養殖產業技術研發中心主任(94.8-97.7)
5. 國立澎湖技術學院學生事務長(89.8-93.7)
6. 國立澎湖海事管理專科學校夜間部主任(88.8-89.7)
7. 國立高雄海事專科學校澎湖分部教學組長(80.8-82.7)
8. 國立澎湖科技大學水產養殖系教授(96.7-110.7)
9. 國立澎湖科技大學水產養殖系副教授(87.8-96.6)
10. 國立澎湖科技大學水產養殖系講師(80.8-87.7)

1. 102年帶領學生組成「繽紛海葵魚團隊」，參加國科會102年度第一梯次創新創業激勵計畫競賽，得到「生技醫療」組前四強的佳績。
2. 98年-104年擔任國立澎湖科技大學海洋資源暨工程學院院長，任內教育部100學年度校務評鑑學院及院內5系3所全獲得評鑑1等。
3. 榮獲教育部第一屆99-101年度補助特殊優秀人才彈性薪資，每年50萬元，3年共150萬元。
4. 榮獲教育部93年學務處主管人員服務貢獻感謝獎。

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2. Huang YM, de Voogd NJ, Cleary DFR, Li T-H, Mok H-K, Ueng J-P (2016). Biodiversity pattern of subtidal sponges (Porifera: Demospongiae) in the Penghu Archipelago (Pescadores), Taiwan. Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom 96: 417-427.
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20. 翁進坪、黃娟娟、李明安（2003）九十二年度漁業資源估管理及利用研討會。p166、p394。
21. 翁進坪、翁平勝 (2002)抗風沉降式軟式箱網之研究；澎湖縣暨海南省水產養殖與漁業合作研討會，P.47~52。
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1. 翁進坪（2011）海洋綠金-澎湖海洋濟性藻類週邊產業特色典範計畫，第二年計畫報告(p.p.133)。
2. 翁進坪（2010）海洋綠金-澎湖海洋濟性藻類週邊產業特色典範，第一年計畫報告(p.p.80)。
3. 翁進坪（2009）島嶼海洋產業經濟之重建－創新海洋牧場資源復育與管理之研究計畫報告。
4. 翁進坪（2008）以海鱺、海藻及濾食性貝類整體育種、飼養、銷售、智慧財產保護平台之海產食物供應鏈研究總計畫－水產養殖分項，第三年計畫報告。
5. 翁進坪（2007）以海鱺、海藻及濾食性貝類整體育種、飼養、銷售、智慧財產保護平台之海產食物供應鏈研究總計畫－水產養殖分項，第二年計畫報告。
6. 翁進坪（2007）以海鱺、海藻及濾食性貝類整體育種、飼養、銷售、智慧財產保護平台之海產食物供應鏈研究總計畫－水產養殖分項，第一年計畫報告。
7. Ueng, J. P (2006)Assessment of Substituting Regular or Fermented Soybean Meal for Fish Meal in Diets of Cobia。
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9. 翁進坪（2004）教育部箱網養殖產業技術之研究成果。
10. 翁進坪（2005）教育部箱網養殖產業技術之研究成果。
11. 翁進坪（2006）教育部箱網養殖產業技術之研究成果。
12. 翁進坪（2007）教育部箱網養殖產業技術之研究成果。
13. 翁進坪（2007）教育部箱網與貝類養殖人才培育計畫成果。
14. 翁進坪（2008）教育部箱網與貝類養殖人才培育計畫成果。
15. 翁進坪（2009）教育部箱網與貝類養殖人才培育計畫成果。
16. 翁進坪（2003）澎湖海域黑蝶貝之種苗繁殖。行政院農委會九十二年度實驗研究計畫報告。
17. 翁進坪（2003）台灣各主要河川河口沿岸海域石首魚類之分佈與管理。行政院農委會九十二年度實驗研究計畫報告。
18. 翁進坪（2003）台灣各沿岸海域經濟性黑蝶貝資源生物學特性及其評估管理之研究。行政院農委會九十二年度實驗研究計畫報告。
19. 翁進坪（2002）抗颱風沉降式軟式箱網設計。行政院農委會九十一年度實驗研究計畫報告。
20. 翁進坪（2002）台灣各主要河川河口沿岸海域石首魚類之分佈與管理-曾文溪、高屏溪河口海域調查。行政院農委會九十一年度實驗研究計畫報告。
21. 翁進坪（2001）沉降式軟式抗颱風箱網設計之研究。行政院農委會九十一年度實驗研究計畫報告。
22. 翁進坪（2001）濁水溪河口海岸石首魚類之分佈與管理。行政院農委會九十年度實驗研究計畫報告。
23. 翁進坪（1999）複式軟式箱網網具設計與效益評估。行政院農委會八十八年度實驗研究計畫報告。
24. 翁進坪（1999）澎湖箱網養殖區環境監測。行政院農委會八十八年度實驗研究計畫報告。
25. 翁進坪（1999）澎湖箱網養殖區環境監測。行政院農委會八十九年度實驗研究計畫報告P1-55。
26. 翁進坪（1999）複式軟式箱網網具設計與效益評估。行政院農委會八十八年度實驗研究計畫報告P1-40。
27. 謝寬永、翁進坪（1998）箱網之配置與流水交換，抵抗及容積之研究。行政院農委會八十七年度實驗研究計畫報告。
28. 翁進坪(1998)複式軟式箱網網具設計研究(II)。行政院農委會八十八年度實驗研究計畫報告。
29. 翁進坪(1997)複式軟式箱網網具設計研究(I)。行政院農委會八十七年度實驗研究計畫報告。

其他研究計畫